Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGRPO00253 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGRPO00253 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGRPO00253 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGRPO00253 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGRPO00253 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGRPO00253 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGRPO00253 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGRPO00253 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGRPO00253 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGRPO00253 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGRPO00253 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGRPO00253 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGRPO00253 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGRPO00253 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGRPO00253 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms