Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KT08 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KT08 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
J3KT08 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KT08 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KT08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
J3KT08 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
J3KT08 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
J3KT08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms