Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B2RBV5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B2RBV5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B2RBV5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B2RBV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B2RBV5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B2RBV5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
B2RBV5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B2RBV5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B2RBV5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B2RBV5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B2RBV5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B2RBV5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B2RBV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B2RBV5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B2RBV5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B2RBV5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B2RBV5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B2RBV5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms