Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms