Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL3A8MV65 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms