Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC53A6NM62 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC53A6NM62 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC53A6NM62 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms