Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WTIPA6NIX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WTIPA6NIX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WTIPA6NIX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms