Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLCD2A6NGC4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD2A6NGC4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLCD2A6NGC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms