Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCAF2A6NFQ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCAF2A6NFQ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCAF2A6NFQ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms