Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPN1LA6NDY0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPN1LA6NDY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms