Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRIT2A6NDA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIT2A6NDA9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms