Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMNCA6NCL1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms