Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM43BA6NCK2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM43BA6NCK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms