Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA1A5PL33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA1A5PL33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRBA1A5PL33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms