Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XIRP2A4UGR9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XIRP2A4UGR9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XIRP2A4UGR9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms