Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM30A4D0T7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM30A4D0T7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms