Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC66A2RUB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms