Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F8A0AVK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms