Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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