Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms