Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms