Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms