Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms