Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms