Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms