Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms