Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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