Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms