Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMPRSS4Q9NRS4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms