Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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