Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms