Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms