Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms