Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms