Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms