Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms