Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms