Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C9orf16Q9BUW7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C9orf16Q9BUW7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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