Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HINFPQ9BQA5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms