Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms