Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD5Q99717 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms