Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKP4Q99569 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms