Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms