Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms