Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CDRT15Q96T59 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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