Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms