Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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