Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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