Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLDND2Q8NHS1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDND2Q8NHS1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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