Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms